Cell：复旦大学鲍峰等合作绘制实验小鼠的全身分子和细胞图谱
生命科学
Life science
实验小鼠（laboratory mouse）是生物医学研究中的关键模型系统，但其全身测量工具却一直缺乏。2026年3月27日，复旦大学未来信息创新学院鲍峰青年研究员、芝加哥大学Nicolas Chevrier、北京航空航天大学人工智能学院Li Bohan等，在Cell Press细胞出版社旗下期刊Cell上发表了题为“Whole-body molecular and cellular mapping of the laboratory mouse”的研究论文。该研究成功绘制了实验小鼠的全身分子和细胞图谱。
在这项最新研究中，研究团队生成了全小鼠切片的时空转录组学图谱，能够准确捕捉组织学区域。研究团队通过构建包含5900万个单细胞的参考数据集，并结合一种可扩展的细胞类型分配计算方法，在全小鼠切片图谱中对379种细胞类型进行了空间定位。此外，研究团队利用这些全小鼠图谱创建了一个机器学习方法——LABEL，能够对来自H&E染色切片的组织学图像进行全身组织和细胞类型的注释。
最后，研究团队将全小鼠空间分析应用于内毒素血症（endotoxemia）中全身性炎症的图谱绘制，描绘了组织和细胞类型中基因表达程序的全组织变化。
图1 研究内容示意图
该研究的亮点：
6周龄小鼠全身切片的全转录组谱；
LABEL算法在H&E图像上标注器官、组织和细胞类型；
全身图谱揭示了小鼠内毒素血症的全身性炎症特性；
该研究提供了一种在实验小鼠中开展全身空间分子研究的统一框架。
总体而言，这项工作为研究实验小鼠在空间、时间和条件下的分子和细胞过程的全身性研究铺平了道路。
相关论文信息
论文原文刊载于Cell Press细胞出版社期刊Cell
▌论文标题：
Whole-body molecular and cellular mapping of the laboratory mouse
▌论文网址：
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0092867426002734
▌DOI：
https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.03.006
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