线粒体是真核生物关键细胞器,其主要生物学功能是通过氧化磷酸化,为细胞提供能量ATP,并调控物质合成、细胞命运、Ca2+稳态、氧化还原平衡等。线粒体是半自主性细胞器,拥有自己的基因组。人线粒体基因组含有16569个碱基对,编码37个基因,包括22个tRNA基因,2个rRNA基因,用于翻译产生13种蛋白质【1】,它们都是氧化呼吸链复合物I, III, IV, V的关键核心亚基,且全部是跨线粒体内膜蛋白质,对于氧化呼吸链复合物的组装和功能具有至关重要的作用【2】。因此,线粒体基因组所有基因全部用于线粒体翻译,凸显了线粒体翻译在线粒体结构与功能中的核心作用。
同核基因组类似,线粒体遗传信息传递主要包括DNA复制、RNA转录以及mRNA翻译。氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase, aaRS) 是mRNA翻译过程中的关键酶,通常20种氨基酸分别对应20种aaRS,通过氨基酰化反应将tRNA与对应的氨基酸连接起来,形成正确的氨基酰-tRNA (例如Thr-tRNAThr),为mRNA翻译提供原料【3】。tRNA是分子量约25 kDa的生物大分子,含有被aaRS正确识别的正向/反向识别元件;但氨基酸是小分子,侧链比较相似,很多aaRS很难精准识别对应的氨基酸底物,会形成错误配对的氨基酰-tRNA (例如Ser-tRNAThr)。因此,近半数aaRS进化出编校功能以水解错误的氨基酰-tRNA,确保mRNA翻译的保真性【4】。已有研究表明,细菌、古菌、低等及高等真核生物细胞质aaRS均具有保守的编校结构域;若编校结构域发生功能损伤性变异,将导致mRNA错误翻译,进而引起细胞生长受阻以及神经退行性疾病、心脏病等【5, 6】。
线粒体aaRS却呈现出不同的进化轨迹,人线粒体只含有19种aaRS,绝大多数线粒体aaRS已经完全丧失了编校结构域,只有4种线粒体aaRS [包括TARS2 (苏氨酰-tRNA合成酶), AARS2 (丙氨酰-tRNA合成酶), IARS2 (异亮氨酰-tRNA合成酶), VARS2 (缬氨酰-tRNA合成酶)]具备完整的编校结构域【7】。长期以来,领域内认为线粒体mRNA翻译由于只产生13种蛋白质,共解码3789个密码子;且线粒体内氨基酸组成简单,没有大量的非蛋白质氨基酸;因此,线粒体mRNA翻译应该不需要保真性调控机制【8】。
2023年9月5日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心 (生物化学与细胞生物学研究所) 周小龙课题组与王恩多课题组合作,在PNAS在线发表了题为Mammalian mitochondrial translation infidelity leads to oxidative stress-induced cell cycle arrest and cardiomyopathy的研究论文,揭示哺乳动物线粒体mRNA翻译需要严格的质量控制机制。

总之,本研究通过构建第一个编校缺陷性细胞模型与动物模型,揭示哺乳动物线粒体mRNA翻译虽然“简单”,却需要严格的质量控制机制;在细胞水平上,保真性失衡会导致线粒体错误翻译,进而引起能量供应不足、氧化应激与细胞周期阻滞等;在动物水平上,保真性失衡会导致扩张性心肌病、心脏纤维化等。本研究为线粒体基因表达调控机制提供了新视角。

中科院分子细胞科学卓越创新中心/上科大联合培养博士研究生郑文强为本文第一作者,分子细胞科学卓越创新中心/国科大杭州高等研究院周小龙研究员和分子细胞科学卓越创新中心/上科大王恩多研究员为本文共同通讯作者。分子细胞科学卓越创新中心李劲松研究员、周斌研究员、法国CNRS Gilbert Eriani研究员参与了本研究。
链接:
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2309714120
参考文献
1. T. Suzuki, A. Nagao, T. Suzuki, Human mitochondrial tRNAs: biogenesis, function, structural aspects, and diseases. Annu Rev Genet 45, 299-329 (2011).
2. I. Vercellino, L. A. Sazanov, The assembly, regulation and function of the mitochondrial respiratory chain. Nat Rev Mol Cell Biol, 23, 141-161 (2021).
3. A. Antonellis, E. D. Green, The role of aminoacyl-tRNA synthetases in genetic diseases. Annu Rev Genomics Hum Genet 9, 87-107 (2008).
4. J. Ling, N. Reynolds, M. Ibba, Aminoacyl-tRNA synthesis and translational quality control. Annu Rev Microbiol 63, 61-78 (2009).
5. J. W. Lee et al., Editing-defective tRNA synthetase causes protein misfolding and neurodegeneration. Nature 443, 50-55 (2006).
6. Y. Liu et al., Deficiencies in tRNA synthetase editing activity cause cardioproteinopathy. Proc Natl Acad Sci U S A 111, 17570-17575 (2014).
7. G. X. Peng et al., RNA granule-clustered mitochondrial aminoacyl-tRNA synthetases form multiple complexes with the potential to fine-tune tRNA aminoacylation. Nucleic Acids Res, 50, 12951-12968 (2022).
8. N. M. Reynolds et al., Cell-specific differences in the requirements for translation quality control. Proc Natl Acad Sci U S A 107, 4063-4068 (2010).
原标题:《【学术前沿】PNAS | 周小龙/王恩多团队揭示线粒体翻译保真性失调导致细胞周期阻滞与心脏病》